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广东环境保护工程职业学院中职教育部（原广东省环境保护学校）创办于1978年10月，原隶属于广东省生态环境厅，是全国第一所公办环境保护类专业技术学校，以培养环保、节能、低碳及相关专业高技能型人才为特色，是我省乃至全国环保人才的摇篮，被誉为环保行业的“黄埔军校”。

2010年2月经省人民政府批准成立高职学院，2018年12月转隶广东省教育厅管理。

2021年，广东环境保护工程职业学院与广东省环境保护职业技术学校实施集团办学，设立中职教育部。

2022年，学校成为广东省省域高水平高职院校建设单位。根据"金平果"高职专业竞争力排行榜，学校有5个专业排名全国第一、5个专业排名全国第二、3个专业排名全国第三。根据“GDI高职高专排行榜（2024）”，学校入选“高职院校（广东）20 强”。根据2024年广东高职院校满意度调查结果，学校用人单位满意度排名全省第一。